Для чего нужен промотор
Промотор
Промоторный участок в пределах оперона может частично перекрываться или вовсе не перекрываться с операторным участком цистрона (гена).
То, под каким промотором находится кодирующий РНК участок ДНК, играет решающее значение в интенсивности экспрессии этого гена в каждом конкретном типе клеток. Активация промотора определяется присутствием в каждом типе клеток своего набора транскрипционных факторов
Полезное
Смотреть что такое «Промотор» в других словарях:
промотор — ускоритель, активатор Словарь русских синонимов. промотор сущ., кол во синонимов: 2 • активатор (9) • … Словарь синонимов
ПРОМОТОР — ПРОМОТОР, в химии вещество, применяемое в небольших количествах вместе с катализатором для увеличения активности КАТАЛИЗАТОРА. Например, в ПРОЦЕССЕ ХАБЕРА железо катализатор применяется для ускорения реакции соединения водорода с азотом под… … Научно-технический энциклопедический словарь
промотор — а, м. (нем. Promotor … Словарь иностранных слов русского языка
Промотор — последовательность нуклеотидов в молекуле ДНК, ответственная за начало транскрипции. Источник: Порядок и организация контроля за пищевой продукцией, полученной из/или с использованием сырья растительного происхождения, имеющего генетически… … Официальная терминология
промотор — Последовательность молекулы ДНК, место инициации процесса транскрипции [http://www.dunwoodypress.com/148/PDF/Biotech Eng Rus.pdf] Тематики биотехнологии EN promoter … Справочник технического переводчика
промотор — ПРОМОТЕР, ПРОМОТОР а, м. promoteur m. нем. Promotor <лат. promovere продвигать. един. Инициатор, зачинщик. К концу мая и мы выедем, настоящего плана нет, и хотя <натали> угомонилась, но я главный промотор длинного свиданья на Лимане… … Исторический словарь галлицизмов русского языка
промотор — promoter (promotor) промотор. Участок молекулы ДНК, к которому присоединяются молекулы РНК полимеразы (при этом молекулярные основы взаимодействия между П. и РНК полимеразой пока неясны), что сопровождается инициацией… … Молекулярная биология и генетика. Толковый словарь.
промотор — гидрофобизатор; отрасл. активатор; промотор Вещество, наносимое на поверхность тела с целью поддержания капельной конденсации (путем создания гидрофобного поверхностного слоя) … Политехнический терминологический толковый словарь
промотор — проматор (промотор) натхненник, керівник, покровитель … Зведений словник застарілих та маловживаних слів
ПРОМОТОРЫ
Различают структурообразующие П., увеличивающие число активных центров катализатора, и модифицирующие П., приводящие к изменению типа активных центров. В случае структурообразующих П. увеличение наблюдаемой константы скорости каталитич. р-ции связано с увеличением предэкспоненциального множителя в ур-нии Аррениуса, в случае модифицирующих П.-с уменьшением наблюдаемой энергии активации этой р-ции. Чтобы установить, к какому типу относится тот или иной П., измеряют с помощью физ. адсорбции уд. пов-сть катализатора, а с помощью хемо-сорбции-пов-сть, занятую активными центрами, и определяют влияние П. на величину последней. Модифицирование катализаторов открыто С. З. Рогинским с сотрудниками в 1947.
Лит. см. при статьях Гетерогенный катализ, Катализ, Катализаторы.
Полезное
Смотреть что такое «ПРОМОТОРЫ» в других словарях:
ПРОМОТОРЫ — (от лат. promoveo продвигаю) вещества, добавление которых к катализаторам повышает их активность и избирательность, а иногда и устойчивость. Входят в большинство промышленных катализаторов; напр., в синтезе аммиака катализатор (губчатое железо) в … Большой Энциклопедический словарь
ПРОМОТОРЫ — (активаторы) вещества, усиливающие действие (см.) данной реакции; не являясь катализаторами, они увеличивают их активность, избирательность или устойчивость. Напр. для платиновых катализаторов П. являются железо, алюминий и др … Большая политехническая энциклопедия
промоторы — (от лат. promoveo продвигаю), вещества, добавление которых к катализаторам повышает их активность и избирательность, а иногда и устойчивость. Входят в большинство промышленных катализаторов; например, в синтезе аммиака катализатор (губчатое… … Энциклопедический словарь
Промоторы — (от лат. promoveo продвигаю) активаторы, вещества, добавление которых к катализатору (См. Катализаторы) увеличивает его активность, избирательность или устойчивость. Промотированным катализатором обычно называют такой катализатор, добавка … Большая советская энциклопедия
ПРОМОТОРЫ — (от лат. promoveo продвигаю), активаторы, в ва, добавление к рых в небольших кол вах к катализатору повышает его активность, избирательность или устойчивость. Промотированным катализатором обычно наз. такой, добавка П. к к рому невелика, а сам по … Большой энциклопедический политехнический словарь
ПРОМОТОРЫ — (от лат. promoveo продвигаю), в ва, добавление к рых к катализаторам повышает их активность и избирательность, а иногда и устойчивость. Входят в большинство пром. катализаторов; напр., в синтезе аммиака катализатор (губчатое железо) в качестве П … Естествознание. Энциклопедический словарь
Промоторы — Промотор последовательность нуклеотидов ДНК, узнаваемая РНК полимеразой как стартовая площадка для начала специфической, или осмысленной, транскрипции. У прокариот промотор включает ряд мотивов, важных для узнавания его РНК полимеразой, в… … Википедия
Тандемные промоторы — * тандэмныя прамотары * tandem promoters специальная (определенная) организация последовательностей, когда один промотор (см.) удвоен и два промотора расположены друг за другом. Такие Т. п. характерны генам рДНК и служат для накопления молекул… … Генетика. Энциклопедический словарь
Этиология злокачественных опухолей — Эту статью следует викифицировать. Пожалуйста, оформите её согласно правилам оформления статей. Общая причина злокачественного роста недостаточная активность факторов противоопухолевой защиты, объединяемых в систему антибластомн … Википедия
1 : РНК-полимераза, 2 : репрессор, 3 : промотор, 4 : оператор, 5 : лактоза, 6 : lacZ, 7 : lacY, 8 : lacA.
Внизу : ген включен. Лактоза ингибирует репрессор, позволяя РНК-полимеразе связываться с промотором и экспрессировать гены, которые синтезируют лактазу. В конце концов, лактаза переваривает всю лактозу до тех пор, пока она не перестанет связываться с репрессором. Затем репрессор свяжется с оператором, остановив производство лактазы.
СОДЕРЖАНИЕ
Обзор
Определение относительного местоположения
Относительное расположение в ядре клетки
В ядре клетки, по-видимому, промоторы распределены преимущественно на краю хромосомных территорий, вероятно, для совместной экспрессии генов на разных хромосомах. Кроме того, у людей промоторы проявляют определенные структурные особенности, характерные для каждой хромосомы.
Элементы
Бактериальный
Вероятность появления каждого нуклеотида
Эукариотический
Эукариотические промоторы разнообразны, и их трудно охарактеризовать, однако недавние исследования показывают, что они делятся на более чем 10 классов.
Промоутеры млекопитающих
Активная экспрессия генов у млекопитающих инициируется, когда сигналы передаются промоторам, связанным с генами. Последовательности промоторной ДНК могут включать в себя различные элементы, такие как островки CpG (присутствующие примерно в 70% промоторов), TATA-бокс (присутствующий примерно в 24% промоторов), инициатор (Inr) (присутствующий примерно в 49% промоторов), вышестоящий и расположенные ниже элементы распознавания TFIIB (BREu и BREd) (присутствующие примерно в 22% промоторов) и нижележащий коровый промоторный элемент (DPE) (присутствующий примерно в 12% промоторов). Присутствие множественных метилированных сайтов CpG на островках CpG промоторов вызывает стабильное молчание генов. Однако эксперименты Weingarten-Gabbay et al. показали, что присутствие или отсутствие других элементов имеет относительно небольшое влияние на экспрессию генов. Две последовательности, ТАТА-бокс и Inr, вызывали небольшое, но значительное увеличение экспрессии (увеличение на 45% и 28% соответственно). Элементы BREu и BREd значительно снижали экспрессию на 35% и 20% соответственно, а элемент DPE не оказывал заметного влияния на экспрессию.
На схематической иллюстрации в этом разделе показан энхансер, который зацикливается и находится в непосредственной физической близости с промотором целевого гена. Петля стабилизируется димером соединительного белка (например, димером CTCF или YY1 ), при этом один член димера прикреплен к его мотиву связывания на энхансере, а другой член прикреплен к его мотиву связывания на промоторе (представленном красные зигзаги на иллюстрации). Несколько факторов транскрипции, специфичных для функции клетки (в клетке человека имеется около 1600 факторов транскрипции), как правило, связываются со специфическими мотивами на энхансере, и небольшая комбинация этих связанных с энхансером факторов транскрипции, когда они приближаются к промотору петлей ДНК, регулируют уровень транскрипции целевого гена. Медиатор (коактиватор) (комплекс, обычно состоящий из примерно 26 белков во взаимодействующей структуре) передает регуляторные сигналы от энхансерных ДНК-связанных факторов транскрипции непосредственно ферменту РНК-полимеразы II (pol II), связанному с промотором.
Энхансеры, когда они активны, обычно транскрибируются с обеих цепей ДНК с РНК-полимеразами, действующими в двух разных направлениях, производя две эРНК, как показано на рисунке. Неактивный энхансер может быть связан с неактивным фактором транскрипции. Фосфорилирование фактора транскрипции может активировать его, и этот активированный фактор транскрипции может затем активировать энхансер, с которым он связан (см. Маленькую красную звездочку, представляющую фосфорилирование фактора транскрипции, связанного с энхансером, на иллюстрации). Активированный энхансер начинает транскрипцию своей РНК перед активацией промотора, чтобы инициировать транскрипцию информационной РНК из своего гена-мишени.
Двунаправленный (млекопитающие)
Субгеномный
Обнаружение
Эволюционное изменение
Изменения в промоторных последовательностях имеют решающее значение для эволюции, на что указывает относительно стабильное количество генов во многих клонах. Например, большинство позвоночных имеют примерно одинаковое количество кодирующих белок генов (около 20 000), последовательность которых часто высококонсервативна, поэтому большая часть эволюционных изменений должна происходить из-за изменений в экспрессии генов.
De novo origin промоутеров
Учитывая короткие последовательности большинства промоторных элементов, промоторы могут быстро развиваться из случайных последовательностей. Например, в E. coli
60% случайных последовательностей могут развивать уровни экспрессии, сравнимые с lac-промотором дикого типа только с одной мутацией, и эти
10% случайных последовательностей могут служить активными промоторами даже без эволюции.
Привязка
Процесс связывания промотора имеет решающее значение для понимания процесса экспрессии генов.
Место нахождения
Хотя холофермент РНК-полимеразы проявляет высокое сродство к неспецифическим сайтам ДНК, эта характеристика не позволяет нам уточнить процесс локализации промотора. Этот процесс локализации промотора был приписан структуре холофермента ДНК и сигма 4 комплексам ДНК.
Заболевания, связанные с нарушением функции
Островки CpG в промоторах
Метилирование CpG-островков стабильно заставляет гены молчать
Гипер / гипометилирование промотора CpG при раке
Молчание генов репарации ДНК посредством метилирования CpG-островков в их промоторах, по-видимому, особенно важно при прогрессировании рака (см. Метилирование генов репарации ДНК при раке ).
Канонические последовательности и дикого типа
Использование термина « каноническая последовательность» для обозначения промотора часто проблематично и может привести к неправильному пониманию последовательностей промотора. Канонический в некотором смысле подразумевает совершенное.
В случае сайта связывания фактора транскрипции может существовать единственная последовательность, которая связывает белок наиболее прочно в определенных клеточных условиях. Это можно было бы назвать каноническим.
Однако естественный отбор может способствовать менее энергичному связыванию как способу регуляции транскрипционного выхода. В этом случае мы можем назвать наиболее распространенную последовательность в популяции последовательностью дикого типа. Это может быть даже не самая выгодная последовательность в преобладающих условиях.
Недавние данные также указывают на то, что некоторые гены (включая протоонкоген c-myc ) имеют мотивы G-квадруплекса в качестве потенциальных регуляторных сигналов.
Заболевания, которые могут быть связаны с вариациями
Некоторые случаи многих генетических заболеваний связаны с вариациями промоторов или факторов транскрипции.
Учредительный vs регулируемый
Использование термина
Промотор (молекулярная генетика)
Смотреть что такое «Промотор (молекулярная генетика)» в других словарях:
Список генетических терминов — Эта страница глоссарий. См. также: Список генетических пороков развития и заболеваний Термины генетики в алфавитном поряд … Википедия
Генетическая инженерия — Нокаутные мыши Генетическая инженерия (генная инженерия) совокупность приёмов, методов и технологий получения рекомбинантных РНК и ДНК, выделения генов из организма (клеток), осуществления манипуляций с генами и введения их в другие… … Википедия
Оперон — группа функционально связанных между собой Генов, детерминирующих синтез белков ферментов, относящихся к последовательным этапам какого либо биохимического процесса. Концепция О. как часть теории генетической организации и регуляции… … Большая советская энциклопедия
Транскрипция — I Транскрипция (от лат. transcriptio переписывание) письменное воспроизведение слов и текстов с учётом их произношения средствами определённой графической системы. Т. бывает научная и практическая. Научная Т. применяется в лингвистических … Большая советская энциклопедия
Транскрипция (в биологии) — Транскрипция в биологии, осуществляющийся в живых клетках биосинтез рибонуклеиновой кислоты (РНК) на матрице ‒ дезоксирибонуклеиновой кислоте (ДНК). Т. ‒ один из фундаментальных биологических процессов, первый этап реализации генетической… … Большая советская энциклопедия
Промотор (биология)
Промотор — регуляторная участок ДНК, расположенная перед (по направлению к 5 ‘конца молекулы) открытой рамки считывания гена или в начале оперона, обеспечивая контроль транскрипции этого гена или оперона. Каждый ген или оперон может иметь более одного промотор, регулируемые отдельно друг от друга, и, кроме того, другие регуляторные участки. Промотор необходимо для инициации транскрипции.
Прокариоты
Строение бактериального промотора
Типичный бактериальный промотор содержит 2 последовательности:
Эти последовательности являются консервативными, но отдельные нуклеотиды могут варьировать у разных видов и генов. Кроме того, такие элементы узнаются только сигма-субъединицей РНК-полимеразы массой 70 килодальтон, другие изоформы узнают другие последовательности.
Вблизи промотора могут быть расположены другие регуляторные последовательности: операторы, цис-элементы. Гены бактерий часто объединены в оперон — группы генов, кодирующих определенный биохимический путь, совместно регулируются и расположены близко друг к другу на хромосоме. Оперона могут иметь один или несколько промоторов. Лактазной оперон, который был описан первым, имеет только один промотор, благодаря которому транскрибируется три гена.
Инициация транскрипции
Промотор распознается фактором инициации транскрипции — сигма-субъединицей РНК-полимеразы. Пока сигма-субъединица находится в комплексе с полимеразой, она перебирает последовательности ДНК, пока не наткнется с промотором, последовательности которого у нее самая родственностью. Отключение фактора инициации от промотора происходит одновременно с элонгацией транскрипции.
Промоторы могут иметь разную «силу промотора», то есть связываться с РНК-полимеразной комплексом с разной эффективностью. Слабые промоторы требуют дополнительных факторов для начала транскрипции. Сила промотора также зависит от уровня суперспирализации бактериальной ДНК: при наличии отрицательного скручивания молекулы, она начинает плавиться и транскрипция начинается быстрее.
Эукариот
Эукариот имеют 3 класса РНК-полимеразы, каждый из которых имеет собственные промоторы и механизмы инициации транскрипции.
Строение промотора РНК-полимеразы II
К базальных элементов промотора относятся:
Не все гены эукариот имеют такие элементы.
Инициация транскрипции
В эукариот РНК-полимераза II, которая ответственна за синтез большинства мРНК и некодирующих РНК, представляет собой белковый комплекс из 12 субъединиц. Для инициации транскрипции на промоторе должен собраться пре-инициаторным комплекс из 6 субъединиц.
С ТАТА-боксом связывается белок TBP (англ. TATA-box binding protein), который раскручивает ДНК в месте промотора. Этот белок имеет несколько кофакторов, которые познают другие участки промотора (низовой элемент, ГЦ-бокс), если определенный ген не имеет ТАТА-бокса.